De ledenraad is het hoogste bestuursorgaan van de coöperatie en is een representatieve afspiegeling van de leden. De leden van de ledenraad worden op voordracht van een kandidaatstellingscommissie benoemd door de centrale ledenvergadering. Een lid moet bij benoeming tenminste 75% van het areaal aan de coöperatie leveren.

Het bestuur van de coöperatie is verantwoordelijk voor het reilen en zeilen van de coöperatie, waaronder de behartiging van de belangen van de leden. Het bestuur bestaat uit zeven leden. Vier leden hiervan zijn afkomstig uit de kring van leden aangevuld met drie externe leden. Voor de leden van het bestuur uit de kring van leden geldt dat deze slechts benoemd kunnen worden indien zij bij hun benoeming tenminste 75% van hun areaal aan de coöperatie leveren.

In de rol van leverancier worden de leden vertegenwoordigd door de poolcommissie. De leden van de poolcommissie bespreken de contractvoorwaarden van de teeltovereenkomst.

Het lidmaatschap van Agrico is onlosmakelijk verbonden met het leveren van aardappelen. Met het lidmaatschap als basis, sluit de coöperatie jaarlijks overeenkomsten met de bedrijven van haar leden. Vervolgens worden de aardappelen verhandeld door de B.V. Coöperatie Agrico U.A. heeft twee poolcommissies: één voor pootaardappelen en één voor biologisch geteelde poot- en consumptieaardappelen.

De poolcommissies voeren regelmatig overleg met Agrico over de teelt- en afnamecondities van de poolovereenkomsten. Gedurende het jaar worden productgroep vergaderingen georganiseerd waarbij een afvaardiging van de organisatie en van de poolcommissies met de bedrijven van de leden in gesprek gaan over de relatie tussen teler/lid en de coöperatie.

De commissie van beroep is een onafhankelijke en onpartijdige instantie waar leden terecht kunnen als ze een geschil hebben met de coöperatie over een beslissing van een bestuursorgaan waarvan zij vinden dat deze niet rechtvaardig is. Of over vastgesteld beleid, onjuiste uitvoering van regelingen of bij een geschil met betrekking tot de teeltovereenkomst.

De directie vertegenwoordigt de B.V. en is verantwoordelijk voor de uitvoering van de strategie, het beleid en de operationele activiteiten binnen Agrico. De directie kan zelfstandig besluiten nemen en in de spelregels is precies vastgelegd welke beslissingen dat zijn, voor welke beslissingen de directie eerst goedkeuring moet krijgen van de raad van commissarissen en voor welke beslissingen ook de AVA goedkeuring moet geven.

Agrico beschikt over een jongerencollege. Dit is een vertegenwoordiging van jonge, enthousiaste en vooruitstrevende aardappeltelers uit het gehele land. Het jongerencollege komt een aantal keren per jaar bij elkaar tijdens reguliere vergaderingen en heeft een belangrijke klankbordfunctie voor de directie en het bestuur van Agrico. Met hun verfrissende inzichten leveren zij een belangrijke bijdrage aan de groei van de organisatie.